mercredi 29 septembre 2021

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Plateforme basée sur SeedGerm Raspberry Pi pour l’imagerie automatisée des semences

Un nouvel article publié sur le blog officiel Raspberry Pi cette semaine révèle plus de détails sur SeedGerm, une plate-forme alimentée par Raspberry Pi conçue pour l’imagerie automatisée des graines. La nouvelle plateforme a été créée par des chercheurs du John Innes Center for Plant and Microbial Science. Offrir une plate-forme d’analyse d’images axée sur l’apprentissage automatique pour acquérir une gamme de collections d’images de germination de graines pour différentes espèces de cultures.

«Un phénotype est une caractéristique observable d’un organisme, comme grandir vers la lumière, avoir une queue rayée, ou faire partie de ces personnes qui peuvent faire rouler leur langue. Le phénotype d’un organisme est le résultat des caractéristiques génétiques qu’il possède – son génotype – et de l’environnement dans lequel il vit. Par exemple, le génotype d’une plante peut signifier qu’elle peut croître rapidement et devenir haute, mais si son environnement manque d’eau, elle aura probablement un phénotype à croissance lente et courte. »

«Nous pouvons étudier quels phénotypes de graines semblent être liés à des phénotypes de cultures souhaitables, tels qu’un taux de germination élevé ou la capacité de survivre dans des conditions sèches; en d’autres termes, nous pouvons faire des prédictions sur les graines susceptibles de devenir de bonnes récoltes. Et si nous avons contrôlé l’environnement dans lequel nous effectuons cette recherche, nous pouvons être raisonnablement convaincus que ces «bons» phénotypes de graines ne sont pas principalement dus à des variations des conditions environnementales, mais aux propriétés des graines elles-mêmes: leur génotype.

La source : RPiF : Centre John Innes

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